Penelitian dan pengabdian masyarakat merupakan elemen penting dalam Tri Dharma Perguruan Tinggi. Bagi INAIS aspek ini tidak kalah pentingnya dengan penyelenggaraan pendidikan akademis itu sendiri. Penelitian, riset   dan kajian sangat penting bagi INAIS sebagai sarana berkontribusi bagi perkembangan dan kemajuan ilmu pengetahuan, memajukan peradaban, dan penyediaan konsep-konsep penyelesaian masalah kehidupan di berbagai bidang. Sedangkan pengabdian masyarakat merupakan media implementasi dan aplikasi ilmu dan spirit moral kecendekiawanan secara nyata di tengah masyarakat. Kesadaran akan pentingnya ilmu dan amal, kecendekiawanan dan kemanfaatan telah menjadi spirit sejak kelahiran INAIS. Sebab, bagi para pendiri INAIS, dunia akademis tidak boleh terus-menerus di menara gading intelektualisme, tetapi juga harus hadir dan mendarat di dunia nyata sebagai aktivis, pejuang,  dai,  dan pendamping ummat menuju kejayaan Islam (li I’lai kalimatillah) dan terwujudnya kehidupan yang adil, makmur, sejahtera (rahmatan lil alamin).

Secara kelembagaan, INAIS telah  memiliki Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LPPM). LPPM INAIS mempunyai tugas membantu Rektor untuk menyusun kebijakan penelitian. Selanjutnya, lembaga ini berfungsi melaksanakan, mengkoordinasikan, memantau dan menilai pelaksanaan kegiatan penelitian, PKM serta studi tentang keislaman, kemasyarakatan dan kewirausahaan (berbasis ekonomi syariat dan pengembangan pertanian).